Qsub Submit Binary Optionen

Einreichen von Binärdateien in Grid Engine 6 x. Grid Engine 6 unterstützt die direkte Einreichung von Binärdateien über qsub und qrsh über das neue Argument - byn Das Standardverhalten übernimmt - bn use - by, um direkt eine binäre ausführbare Datei zu starten workgroupcluster. www qrsh - by usr bin Up-Zeit 7 49 bis 107 Tage, 35 Minuten, 0 Benutzer, Last-Mittel 0 12 0 03 0 01 workgroupcluster. Der Befehl qsub 1 kann nicht verwendet werden, um direkt Binärdateien als Jobs zu senden Obwohl man ein kleines Wrapper-Skript um Binärdateien schreiben konnte, um sie einzureichen , Gibt es zwei praktische Techniken, um Binärdateien als Arbeitsplätze sehr einfach ohne Einbeziehung eines separaten Skripts einzureichen. Type der qsub Befehl, zusammen mit allen gewünschten Flags und Optionen, dann drücken Sie die Rückkehr ohne Angabe eines Job-Skript Sie sehen dann eine sekundäre Shell-Eingabeaufforderung Eingabeaufforderung können Sie den Namen der Binärdatei eingeben. Sie können dann die Rückkehr drücken und weiterhin Binär - oder Shell-Befehle eingeben. Wenn Sie Ihren Job angeben, drücken Sie Control-D. QSl Bogen solaris64 schlafen 60 ctrl-D Ihre Arbeit 47427 STDIN wurde eingereicht. Type der qsub Befehl, zusammen mit allen gewünschten Flags und Optionen, dann verwenden Sie die STDIN Umleitung Bau MARKER Geben Sie eine oder mehrere Zeilen mit einer Kombination von Binärdateien und Shell-Befehle an der sekundären Eingabeaufforderung wie oben Dann geben Sie auf einer Zeile von selbst den MARKER ein und drücken Sie die Eingabetaste. Qsub - N Test EOF schlafen 60 EOF Ihr Job 47428 Test wurde eingereicht. Beide Techniken oben nutzen die Tatsache, dass qsub den STDIN-Stream als Job-Skript verwendet, wenn Sie don t spezifizieren eine Skript-Datei als Argument. Für nahtlos integrieren bestimmte Anwendungen in Ihrer Umgebung mit einem Grid Engine-Cluster, könnte es notwendig sein, ein benutzerdefiniertes Wrapper-Skript zu schreiben, das einige Setup-Arbeiten vor dem Ausführen eines Jobs macht. Die zweite Technik von oben kann in solche Wrapper-Skripte eingebettet werden. Example erstellen Wrapper für die Übermittlung einer binären Charge Job von einem SunRay zu einer Back-End-Farm Um dies zu tun, ist es notwendig, die LDPRELOAD-Variable zu ändern, um SunRay-spezifische Eintrag zu entfernen. Ein generisches Binär-Sende-Wrapperskript qbsub kann bei diesem Link gefunden werden. Es kann als binäre Version verwendet werden Von qsub Das Wrapper-Skript ermöglicht es dem Einreicher, die Standard-Einreichungs-Flags zu verwenden, und es berücksichtigt auch die Flags, die in der qtask-Datei angegeben sind, die von qtcsh verwendet wird, wenn transparente Binärdateien dem syst übertragen werden Em. Ein Beispiel für die Verwendung dieses Skripts ist. Dies läuft die Netscape-Binärdatei, während explizit die DISPLAY-Umgebungsvariable HINWEIS müssen Sie natürlich sicherstellen, dass die Binärzahl die Architektur, auf der es schließlich ausgeführt wird, können Sie dies z. By do. How, um einen Job mit qsub. qsub zu senden, ist ein Befehl, der für die Einreichung des SGE-Clusters verwendet wird. Im Abschnitt 2 1 Quickstart und Grundlagen haben wir gezeigt, dass Sie einen Beispielauftrag mit qsub wie folgt einreichen können. Die allgemeine Syntax von wie Zu verwenden qsub ist unten. Hier sind die einige der Optionen und ihre Erklärungen.-q Warteschlange setzen die Warteschlange Oft werden Sie die Standard-Warteschlange verwenden, so dass keine Notwendigkeit, diese up.-V wird alle Umgebungsvariablen an den Job übergeben. - v var-Wert wird speziell passieren Umgebungsvariable var an den Job.-by erlauben Befehl, eine Binärdatei anstelle eines Skripts zu sein. - wir überprüfen Optionen und abbrechen, wenn es einen Fehler gibt.-N Jobname Name des Jobs Dies werden Sie Sehen Sie, wenn Sie qstat verwenden, um den Status Ihrer Jobs zu überprüfen. L hvmem Größe spezifizieren die Menge an maximalem Speicher erforderlich zB 3G oder 3500M HINWEIS Dies ist Speicher pro Prozessor-Slot Also, wenn Sie für 2 Prozessoren fragen Gesamtspeicher wird 2 hvmemvalue.-l hrt hh mm ss geben die maximale Laufzeit Stunden, Minuten und Sekunden.-l srt hh mm ss spezifizieren die weichen Laufzeit Begrenzungsstunden, Minuten und Sekunden - Denken Sie daran, sowohl srt als auch hrt.-pe smp nslots festzulegen. Dies gibt die parallele Umgebung an smp führt einen parallelen Job mit Shared-Memory und NProcessors aus Cores.-cwd läuft im aktuellen Arbeitsverzeichnis.-wd dir Set Arbeitsverzeichnis für diesen Job als dir.-o outputlogfile Name der Ausgabedatei-Datei.-e errorlogfile Name der Fehlerprotokolldatei.-m ea Wird E-Mail senden, wenn Job Beendet oder abbricht.-P projectName setze den Job s projekt.-M email adress E-Mail-Adresse, um E-Mail zu senden.-T start-end incr einen Job-Array mit Startindex-Stopp-Index in Schritten mit eintragen. Sie können die vollständige Liste der Argumente und sehen Erklärungen hier. Jetzt sehen wir einige Beispiel bash Skripte und qsub Befehle Dass diese Aufträge an den Cluster übergeben. Benutzen eines bowtie job. Bowtie ist ein Short-Read-Aligner verwendet, um Liest von Next-Gen-Sequenzierung Maschinen auszurichten Das Skript enthält die Kommandozeilen-Optionen innerhalb, so dass keine Notwendigkeit, diese Optionen auf der Kommandozeile In Ein Shell-Skript, können Sie die qsub-Optionen in Zeilen, die beginnen mit Dies eine Alternative zu übergeben sie mit dem qsub command. Since die Optionen, die wir kümmern uns im Skript sind, müssen wir nicht übergeben sie mit dem qsub Befehl Die Zeilen Beginnend mit sind die oben beschriebenen qsub-Optionen Sie passen den Job an und fragen nach Ressourcen wie CPU und Speicher. Die Eingabedateien für den bowtie-Befehl werden in infile outfile - und btindex-Variablen gespeichert. Dann wird an den bowtie-Befehl übergeben. Das ist nicht wirklich notwendig Aber es ist einfacher, später zu lesen, was los ist. Die Ausführung von bowtie beginnt mit der gzip - dc Da Fastq-Dateien komprimiert sind, müssen wir sie zuerst dekomprimieren und die Ausgabe an bowtie über die Pipe füttern. - chunkmbs 300 - be St - m 1 - p 6 --phred33 - q sind bowtie spezifische Optionen Schauen Sie sie in der Bowtie manual. And, können Sie dies wie folgt ausführen, vorausgesetzt, diese Datei wird gespeichert als. mehr Beispiele zu kommen. Senden von Binärdateien in Grid Engine 6.Grid Engine 6 unterstützt die direkte Einreichung von Binärdateien über qsub und qrsh über das neue Argument - byn Das Standardverhalten übernimmt - bn use - by, um direkt eine binäre ausführbare Datei zu starten workgroupcluster. www qrsh - by usr bin uptime 7 49 bis 107 Tage, 35 Minuten, 0 Benutzer, Last-Mittel 0 12 0 03 0 01 workgroupcluster. Der Befehl qsub 1 kann nicht verwendet werden, um direkt Binärdateien als Jobs zu senden Obwohl man ein kleines Wrapper-Skript um Binärdateien schreiben konnte, um sie einzureichen, gibt es zwei praktische Techniken Melden Sie Binärdateien einfach als einfach ein, ohne ein separates Skript einzutragen. Geben Sie den Befehl qsub zusammen mit den gewünschten Flags und Optionen ein, und drücken Sie die Eingabetaste, ohne ein Job-Skript anzugeben. Sie sehen dann eine sekundäre Shell-Eingabeaufforderung. An dieser Eingabeaufforderung können Sie die Name der Binär Y Sie können dann die Eingabetaste drücken und weiterhin Binär - oder Shell-Befehle eingeben. Wenn Sie Ihren Job angeben, drücken Sie Control-D. QSl Bogen solaris64 schlafen 60 ctrl-D Ihre Arbeit 47427 STDIN wurde eingereicht. Type der qsub Befehl, zusammen mit allen gewünschten Flags und Optionen, dann verwenden Sie die STDIN Umleitung Bau MARKER Geben Sie eine oder mehrere Zeilen mit einer Kombination von Binärdateien und Shell-Befehle an der sekundären Eingabeaufforderung wie oben Dann geben Sie auf einer Zeile von selbst den MARKER ein und drücken Sie die Eingabetaste. Qsub - N Test EOF schlafen 60 EOF Ihr Job 47428 Test wurde eingereicht. Beide Techniken oben nutzen die Tatsache, dass qsub den STDIN-Stream als Job-Skript verwendet, wenn Sie don t spezifizieren eine Skript-Datei als Argument. Für nahtlos integrieren bestimmte Anwendungen in Ihrer Umgebung mit einem Grid Engine-Cluster, könnte es notwendig sein, ein benutzerdefiniertes Wrapper-Skript zu schreiben, das einige Setup-Arbeiten vor dem Ausführen eines Jobs macht. Die zweite Technik von oben kann in solche Wrapper-Skripte eingebettet werden. Example erstellen Wrapper für die Übermittlung einer binären Charge Job von einem SunRay zu einer Back-End-Farm Um dies zu tun, ist es notwendig, die LDPRELOAD-Variable zu ändern, um SunRay-spezifische Eintrag zu entfernen. Ein generisches Binär-Sende-Wrapperskript qbsub kann bei diesem Link gefunden werden. Es kann als binäre Version verwendet werden Von qsub Das Wrapper-Skript ermöglicht es dem Einreicher, die Standard-Einreichungs-Flags zu verwenden, und es berücksichtigt auch die Flags, die in der qtask-Datei angegeben sind, die von qtcsh verwendet wird, wenn transparente Binärdateien dem syst übertragen werden Em. Ein Beispiel für die Verwendung dieses Skripts ist. Dies läuft die Netscape-Binärdatei, während explizit die DISPLAY-Umgebungsvariable HINWEIS müssen Sie natürlich sicherstellen, dass die Binärzahl die Architektur, auf der es schließlich ausgeführt wird, können Sie dies z. Um zu tun, um einen Job zu erstellen, um ein ausführbares Skript an einen Batch-Server zu senden. Der Batch-Server ist der Standard-Server, wenn die Option - q nicht angegeben ist. Der Befehl analysiert ein Skript vor der eigentlichen Skriptausführung, es führt kein Skript selbst aus Alle Skript-Schreibregeln bleiben in Kraft, einschließlich der am Kopf der Datei siehe Diskussion über PBSDEFAULT unter Umgebungsvariablen Typischerweise ist das Skript ein Shell-Skript, das von einer Befehlsshell wie zB sh oder csh. Options auf dem qsub ausgeführt wird Befehl erlauben die Angabe von Attributen, die das Verhalten des Auftrags beeinflussen. Der qsub-Befehl übergibt bestimmte Umgebungsvariablen im VariableList-Attribut des Auftrags Diese Variablen werden avai An den Job geben Der Wert für die folgenden Variablen wird aus der Umgebung des qsub-Befehls HOME, LANG, LOGNAME, PATH, MAIL, SHELL und TZ übernommen. Diese Werte werden einem neuen Namen zugewiesen, dem der aktuelle Name vorangestellt ist Der String PBSO Zum Beispiel hat der Job Zugriff auf eine Umgebungsvariable namens PBSOHOME, die den Wert der Variablen HOME in der qsub Befehlsumgebung haben. Zusätzlich zu den oben genannten sind die folgenden Umgebungsvariablen für den Batchjob verfügbar Name des Hosts, auf dem der qsub-Befehl ausgeführt wird. Der Hostname des pbsserver, den qsub den Job abgibt. Der Name der ursprünglichen Warteschlange, der der Job übergeben wurde. Der absolute Pfad des aktuellen Arbeitsverzeichnisses des qsub-Befehls. Jedem Mitglied eines Job-Arrays wird ein eindeutiger Bezeichner zugewiesen, siehe - t option. Set to PBSBATCH, um anzugeben, dass der Job ein Batch-Job ist oder PBSINTERACTIVE, um anzuzeigen, dass der Job ein PBS-Interaktions-Job ist, siehe Option - I. Der Name der Datei Mit th E Liste der zugewiesenen GPUs. Die Jobbezeichnung, die dem Job vom Batch-System zugewiesen ist, kann in den Stdout - und Stderr-Pfaden verwendet werden. TORQUE ersetzt PBSJOBID mit dem Job s jobid zum Beispiel PBS - o. Der vom Benutzer gelieferte Jobname. Der Name der Datei enthält die Liste der Knoten, die dem Job für Parallel - und Clustersysteme zugeordnet sind. Hiermit wird die Zeit, nach der der Job für die Ausführung berechtigt ist. Das Datums-Argument ist in der Form. wo CC die ersten beiden Ziffern des Jahres ist Das Jahrhundert, YY ist die zweite zwei Ziffern des Jahres, MM ist die zwei Ziffern für den Monat, DD ist der Tag des Monats, hh ist die Stunde, mm ist die Minute, und die optionale SS ist die Sekunden Monat MM ist nicht angegeben, es wird standardmäßig auf den aktuellen Monat, wenn der angegebene Tag DD in der Zukunft ist. Andernfalls wird der Monat auf den nächsten Monat gesetzt werden. Ebenso, wenn der Tag DD nicht angegeben ist, wird es standardmäßig, wenn die Zeit Hhmm ist in der Zukunft Andernfalls wird der Tag auf morgen gesetzt sein. Zum Beispiel, wenn Sie einen Job einreichen T 11 15 Uhr mit einer Zeit von - a 1110 der Job ist berechtigt, um 11 10 Uhr morgen laufen zu können. Definiert den Kontostand, der mit dem Job verknüpft ist Der Accountstring ist eine undefinierte Zeichenfolge und wird von dem Server interpretiert, der den Job ausführt Siehe Abschnitt 2 7 1 des PBS ERS. Definiert die maximale Anzahl von Sekunden qsub blockiert den Versuch, pbsserver zu kontaktieren Wenn pbsserver ausgeschaltet ist oder für eine Vielzahl von Kommunikationsfehlern, wird qsub kontinuierlich die Verbindung zum pbsserver für die Job-Einreichung wiederholen. Dieser Wert überschreibt Der CLIENTRETRY-Parameter in Dies ist eine nicht portable TORQUE-Erweiterung Portabilitätsgesteuerte Benutzer können die PBSCLIENTRETRY-Umgebungsvariable verwenden Ein negativer Wert wird als unendlich interpretiert Der Standardwert ist 0.Definiert die Optionen, die für den Job gelten Wenn der Job auf einem Host ausgeführt wird Die den Checkpoint nicht unterstützt, werden diese Optionen ignoriert. Valid Checkpoint Optionen sind. none Keine Checkpointing ist durchgeführt werden. enabled Geben Sie an, dass Checkpointing erlaubt ist aber mus T explizit entweder durch die qhold oder qchkpt commands. shutdown aufgerufen werden. Geben Sie an, dass das Checkpointing auf einem Job bei pbsmom shutdown. periodic durchgeführt werden soll. Geben Sie an, dass das periodische Checkpointing aktiviert ist. Das Standardintervall beträgt 10 Minuten und kann durch die Option checkpointinterval geändert werden MOM-Konfigurationsdatei oder durch Angabe eines Intervalls, wenn der Job gesendet wird. Intervallminuten Checkpointing ist in einem Intervall von Minuten durchzuführen, was die ganzzahlige Anzahl von Minuten der vom Job verwendeten Zeit ist. Dieser Wert muss größer als Nulltiefe sein Zahl Geben Sie eine Zahltiefe von Checkpoint-Bildern an, die im Checkpoint-Verzeichnis aufbewahrt werden sollen. dir-Pfad Geben Sie einen Checkpoint-Verzeichnis an. Standard ist der Spindel-Drehmoment-Checkpoint. Hiermit wird das Präfix definiert, das eine Anweisung zum qsub-Befehl innerhalb der Skriptdatei deklariert. Siehe Absatz auf Skriptrichtlinien Unter Erweiterte Beschreibung. Wenn die - C-Option mit einem directiveprefix-Argument versehen ist, das die Nullzeichenfolge ist, wird qsub die Skriptdatei nicht scannen Für directives. Definiert den Arbeitsverzeichnispfad, der für den Job verwendet werden soll Wenn die Option - d nicht angegeben ist, ist das Standardarbeitsverzeichnis das Home-Verzeichnis Diese Option setzt die Umgebungsvariable PBSOINITDIR. Definiert das Stammverzeichnis, das für den Job verwendet werden soll Option setzt die Umgebungsvariable PBSOROOTDIR. Definiert den Pfad, der für den Standardfehlerstrom des Batchjobs verwendet werden soll. Das Pfadargument ist von der Form. wo ist Hostname der Name eines Hosts, an den die Datei zurückgegeben wird, und Pfadname ist der Pfadname auf dem Host in der von POSIX erkannten Syntax Das Argument wird wie folgt interpretiert. pfadname wobei Pfadname kein absoluter Pfadname ist, dann wird der Befehl qsub den Pfadnamen relativ zum aktuellen Arbeitsverzeichnis des Befehls erweitern. Der Befehl wird Geben Sie den Namen des Hosts an, auf dem er für den Hostnamen component. hostname Pfadname ausführt, wobei Pfadname kein absoluter Pfadname ist, dann wird der Befehl qsub den Pfadnamen relat nicht erweitern Ive zum aktuellen Arbeitsverzeichnis des Befehls Bei der Auslieferung des Standardfehlers wird der Pfadname relativ zum Benutzerhomeverzeichnis auf dem Hostnamen system. pathname erweitert, wobei Pfadname einen absoluten Pfadnamen angibt, dann gibt der qsub den Namen des Der Host, auf dem es für den Hostname. hostname Pfadname ausgeführt wird, wobei Pfadname einen absoluten Pfadnamen angibt, wird der Pfad als angegeben verwendet. Wenn die Option - e nicht angegeben ist, wird der Standarddateiname für den Standardfehlerstrom verwendet Der Standardname hat das folgende Formular. Wo Jobname ist der Name des Jobs sehen Sie die - Name Option und Sequenznummer ist die Job-Nummer zugewiesen, wenn der Job eingereicht wird. Job ist fehlertolerant gemacht Jobs, die auf mehrere Knoten werden regelmäßig von Mutter überlegen abgefragt Wenn einer der Knoten nicht Bericht, wird der Job von Mutter überlegen abgesagt und ein Fehler wird gemeldet Wenn ein Job fehlertolerant ist, wird es nicht storniert basierend auf fehlgeschlagenen Polling egal wie viele Knoten nicht zu melden Dies kann wünschenswert sein, wenn vorübergehende Netzwerk Ausfälle verursachen große Aufträge Nicht zu vervollständigen, wo Ignorieren eines fehlgeschlagenen Polling-Versuchs bei dem nächsten Polling-Versuch korrigiert werden kann. Wenn TORQUE mit PBSNOPOSIXVIOLATION kompiliert ist, gibt es hier keine Konfigurationsoption, du musst - W fehlertolerant sein, um den Job als fehlertolerant zu markieren. Specfies Die Argumente, die an das Job-Skript übergeben werden, wenn das Skript gestartet wird Die akzeptierte Syntax is. qsub - F myarg1 myarg2 myarg3 myarg3value. Quotation marks sind erforderlich qsub wird mit einem Fehler mes fehlschlagen Salbei, wenn das Argument nach - F kein notierter Wert ist Der pbsmom-Server übergibt den zitierten Wert als Argumente an das Job-Skript, wenn es das Skript startet. Die Option - W erlaubt die Angabe zusätzlicher Jobattribute Die allgemeine Syntax von - W Ist in der Form. Wenn Weißraum irgendwo innerhalb der Option Argument String oder das Gleichheitszeichen auftritt, tritt innerhalb einer Attributwertfolge String, dann muss die Zeichenfolge entweder mit einzelnen oder doppelte Anführungszeichen eingeschlossen werden. PBS unterstützt derzeit die folgenden Attribute innerhalb der - W option. depend dependencylist Definiert die Abhängigkeit zwischen diesem und anderen Jobs Der Dependencylist ist in der Form. Das Argument ist entweder eine numerische Zählung oder eine PBS-Job-ID nach Typ If-Argument ist ein Count, muss es größer sein als 0 Wenn es ist Eine Job-ID und nicht vollständig in der Form angegeben, wird es entsprechend den Standard-Server-Regeln erweitert, die für Job-IDs auf die meisten Befehle gelten Wenn Argument null ist, muss der vorhergehende Doppelpunkt nicht angegeben werden, die dependen Cy der entsprechenden Typ wird gelöscht unset Für weitere Informationen siehe abhängig dependencylist gültige dependencies. grouplist glist Definiert den Gruppennamen, unter dem der Job auf dem Ausführungssystem ausgeführt werden soll Das Glist-Argument ist vom Formular. Es kann nur ein Gruppenname angegeben werden Pro spezifizierter Host Nur eine der Gruppenspezifikationen kann ohne die entsprechende Host-Spezifikation geliefert werden. Der Gruppenname wird für die Ausführung auf einem beliebigen Host verwendet, der nicht in der Argumentliste benannt ist. Wenn nicht gesetzt, wird die Grupplist standardmäßig auf die primäre Gruppe des Benutzers gesetzt, unter der die Job wird ausgeführt. interactive true Wenn das interaktive Attribut angegeben ist, ist der Job ein interaktiver Job Die Option - I ist eine alternative Methode zur Angabe dieses attribute. jobradix int Um mit parallelen Jobs verwendet zu werden, leitet er die Mutter Superior des Jobs an Erstellen einer Verteilungsradie der Größe int zwischen den Schwestern Siehe Verwalten von Mehrknoten jobs. stageout filelist Gibt an, welche Dateien inszeniert werden, bevor sie vor dem Start des Jobs kopiert oder inszeniert werden Fter der Job beendet die Ausführung Nach Beendigung des Jobs werden alle inszenierten und inszenierten Dateien aus dem Ausführungssystem entfernt. Die Dateiliste befindet sich in der Form. Unabhängig von der Richtung der Kopie Der Name localfile ist der Name der Datei auf Das System, in dem der Job ausgeführt wird Es kann ein absoluter Pfad oder relativ zum Home-Verzeichnis des Benutzers sein Der Name remotefile ist der Zielname auf dem Host, der von Hostname angegeben wird. Der Name kann absolut oder relativ zum Benutzer-Home-Verzeichnis auf dem Zielhost sein Die Verwendung von Wildcards im Dateinamen wird nicht empfohlen Die Dateinamen zu einem entfernten Kopierprogramm rcp Aufruf auf dem Ausführungssystem in der folgenden Weise. Für stagein rcp hostname remotefile localfile. For stageout rcp localfile hostname remotefile. Data Staging Beispiele. If TORQUE wurde mit wordexp-Unterstützung kompiliert, dann können Variablen in den angegebenen Pfaden verwendet werden. Zurzeit werden nur PBSJOBID HOME und TMPDIR für stagein. umask unterstützt. XXX Setzt Umask zum Erstellen von Stdout Und stderr-Spool-Dateien im pbsmom-Spool-Verzeichnis Werte, die mit 0 beginnen, werden als Oktalwerte behandelt, andernfalls wird der Wert als dezimaler Umask-Wert behandelt. Wenn Sie einen interaktiven Job mit einem Skript einreichen, wird das Skript für PBS-Richtlinien analysiert Aber der Rest des Skripts wird ignoriert, da es sich um einen interaktiven Job handelt. Die Option - x erlaubt es, das Skript im interaktiven Job auszuführen und dann der Job abzuschließen. Bin bash ls --- end script --- qsub - I qsub wartet auf Job, um E-Mail-geschützt zu starten zeigt den Inhalt des Verzeichnisses, wegen der ls Befehl qsub job complete. Enables X11 Weiterleitung Die DISPLAY Umgebungsvariable muss gesetzt werden. Wenn Dieser Job beendet die Ausführung, Aufträge in arrayid können beginnen. Wenn eine der vorherigen Formulare verwendet wird, müssen die von arrayid referenzierten Aufträge mit einem Abhängigkeitstyp von on eingereicht worden sein. Wenn eine der vorherigen Formulare verwendet wird, werden die von arrayid referenzierten Jobs angegeben Muss denselben Besitzer haben wie der Auftrag, der eingereicht wird. Andernfalls wird die Abhängigkeit ignoriert. Error-Verarbeitung des Existenz-, Zustand - oder Zustandes des Auftrags, auf dem der neu übermittelte Auftrag ein aufgeschobener Dienst ist, dh die Prüfung wird nach dem Auftrag durchgeführt In der Warteschlange Wenn ein Fehler erkannt wird, wird der neue Job vom Server gelöscht. Die Mail wird an den Job-Einsender gesendet, der den Fehler angibt. qsub - W tmp script. qsub - W hängt von afterokarray 427 ab. Dies setzt voraus, dass jeder Job im Array 427 muss Beenden Sie erfolgreich für den depe Ndency to satisf satisf. qWWW hängt afterokarray 427 5. Dies bedeutet, dass 5 der Jobs im Array 427 erfolgreich beendet werden müssen, damit die Abhängigkeit erfüllt werden kann. Der qsub-Befehl akzeptiert einen Skriptoperand, der der Pfad zum Skript ist Des Auftrags Wenn der Pfad relativ ist, wird er relativ zum Arbeitsverzeichnis des qsub Befehls erweitert. Wenn der Skriptoperand nicht vorhanden ist oder der Operand das einzelne Zeichen ist, liest der Befehl qsub das Skript aus der Standardeingabe Skript wird aus der Standard-Eingabe gelesen, qsub wird die Datei in eine temporäre Datei kopieren Diese temporäre Datei wird an die Bibliotheksschnittstellenroutine übergeben. Pbssubmit Die temporäre Datei wird von qsub entfernt, nachdem pbssubmit zurückgegeben wurde oder bei dem Empfang eines Signals, das zu qsub führen würde Beenden. Der qsub-Befehl liest das Skript für den Job aus der Standard-Eingabe, wenn der Skriptoperand fehlt oder das einzelne Zeichen ist. Die Skriptdatei wird von dem qsub-Befehl gelesen, der auf alle in th E script. Wenn der Job erstellt wird, wird eine Kopie der Skriptdatei erstellt und diese Kopie kann nicht geändert werden. Wenn nicht die Option - z gesetzt ist, wird die dem Job zugewiesene Jobkennung in den Standardausgang geschrieben, wenn der Job erfolgreich ist Erstellt. Der qsub-Befehl schreibt eine Diagnosemeldung an den Standardfehler für jedes Fehlerereignis. Die Werte einiger oder aller Variablen in der qsub-Befehlsumgebung werden mit dem Job exportiert, siehe die Optionen - v und - v. Die Umgebungsvariable PBSDEFAULT Definiert den Namen des Standardservers Typischerweise entspricht er dem Systemnamen des Hosts, auf dem der Server läuft Wenn PBSDEFAULT nicht gesetzt ist, wird die Voreinstellung durch eine Administrator-Setup-Datei definiert. Die Umgebungsvariable PBSDPREFIX bestimmt den Präfix-String, der identifiziert Richtlinien in der Skript. Die Umgebungsvariable PBSCLIENTRETRY definiert die maximale Anzahl von Sekunden qsub wird blockieren die Option - b Trotz des Namens, derzeit ist qsub der einzige Client, der diese o unterstützt Ption. Die Datei, die sich im PBSSERVERHOME var-Spool-Drehmoment befindet, steuert standardmäßig das Verhalten des qsub-Befehls Diese Datei enthält eine Liste von Parametern und Werten, die durch whitespace getrennt sind. QSUBSLEEP nimmt einen Integer-Operanden, der die Zeit zum Einschlafen festlegt, wenn der Befehl qsub ausgeführt wird Benutzer aus dem Überwältigen des Schedulers. SUBMITFILTER gibt den Pfad zum Übermittlungsfilter an, der zur Vorverarbeitung der Auftragseinreichung verwendet wird. Der Standardpfad ist libexecdir qsubfilter, der auf uns zurückgeht. Lokaler sbin torquesubmitfilter für Rückwärtskompatibilität Dieser Parameter überschreibt diese Voreinstellung. Ein Job-Skript kann bestehen Von PBS-Richtlinien, Kommentaren und ausführbaren Aussagen Eine PBS-Richtlinie bietet eine Möglichkeit, neben den Befehlszeilenoptionen auch Jobattribute anzugeben. PBS - l walltime 10 30, mem 320kb. step1 arg1 arg2.step2 arg3 arg4.Der qsub-Befehl scannt die Zeilen der Skriptdatei nach den Anweisungen Eine Anfangszeile im Skript, die mit den Zeichen beginnt oder das Zeichen wird ignoriert und das Scannen wird Start mit der nächsten Zeile Das Scannen wird fortgesetzt, bis die erste ausführbare Zeile, dh eine Zeile, die nicht leer ist, keine Richtungszeile, noch eine Zeile, deren erstes nicht-leeres Leerzeichen If ist, wenn Anweisungen in nachfolgenden Zeilen auftreten, werden sie ignoriert. Eine Zeile in der Skriptdatei wird als eine Anweisung zu qsub nur dann verarbeitet, wenn die Zeichenfolge, die mit dem ersten Nicht-Leerzeichen auf der Zeile beginnt, und der gleichen Länge wie das Richtungspräfix mit dem Richtungspräfix übereinstimmt Die richtlinienzeile besteht aus den optionen zu qsub in der gleichen syntax wie sie auf der kommandozeile erscheinen. Das optionzeichen ist dem - zeichen vorzugeben. Wenn eine Option sowohl in einer Anweisung als auch in der Befehlszeile vorhanden ist, ist diese opti Auf und sein Argument, wenn überhaupt, wird in der Richtlinie ignoriert Die Kommandozeile hat Vorrang. Wenn eine Option in einer Anweisung und nicht auf der Befehlszeile vorhanden ist, wird diese Option und ihr Argument, falls vorhanden, so verarbeitet, als ob es Auf der Kommandozeile aufgetreten ist. Der Richtungspräfix-String wird in der Reihenfolge der Präferenz aus dem Wert des - c Option-Arguments bestimmt, wenn die Option auf der Kommandozeile angegeben ist. Der Wert der Umgebungsvariablen PBSDPREFIX, wenn er definiert ist. Die vier Zeichenfolge PBS. Wenn die Option - c in einer Anweisung in der Skriptdatei gefunden wird, wird sie ignoriert. Wenn der Benutzer einen Job von einem anderen System als dem, auf dem der PBS Server ausgeführt wird, einreicht, wird der Name unter Die der Job auszuführen ist, wird nach den unter der Option - u aufgeführten Regeln ausgewählt. Der Benutzer, der den Job einreicht, muss autorisiert sein, den Job unter dem Ausführungsbenutzernamen auszuführen. Diese Berechtigung wird zur Verfügung gestellt. Der Host, auf dem qsub ausgeführt wird, ist Vertraut durch die ausführende host see. The e Xecution-Benutzer hat eine Datei, die den übertragenden Benutzer auf der Einreichung host. C-Shell-Datei benennt. Die folgende Warnung gilt für Benutzer der c-Shell, csh Wenn der Job unter dem csh ausgeführt wird und eine Datei im Home-Verzeichnis existiert Der Job wird ausgeführt, der Exit-Status des Jobs ist der des Skripts, nicht das Job-Skript Dies kann Auswirkungen auf jegliche Inter-Job-Abhängigkeiten Um den Job-Exit-Status zu behalten, entfernen Sie entweder die Datei oder legen Sie die folgende Zeile als die erste Zeile in der File. set EXITVAL status. and die folgende Zeile als die letzte ausführbare Zeile in. Wenn die Option - I auf der Kommandozeile oder in einer Skriptrichtlinie angegeben ist oder wenn das interaktive Jobattribut über die Option - W als true markiert ist, - W Interaktive true entweder auf der Kommandozeile oder in einer Skript-Direktive, ist der Job ein interaktiver Job Das Skript wird für Anweisungen verarbeitet werden, wird aber nicht mit dem Job aufgenommen werden Wenn der Job beginnt Ausführung, alle Eingaben in den Job ist vom Terminal Sitzung, in der qsub läuft. Wenn ein int Eraktiver Job wird abgelegt, der qsub-Befehl wird nicht beendet, wenn der Job eingereicht wird q wird weiterlaufen, bis der Job beendet wird, abgebrochen wird oder der Benutzer qsub mit einem SIGINT die Control-C-Taste unterbricht Wenn qsub vor dem Jobstart unterbrochen wird, Es wird abgefragt, ob der Benutzer zu beenden will Wenn die User-Antwort ja, qsub beendet und der Job abgebrochen wird. Wenn der interaktive Job die Ausführung gestartet hat, eingegeben und aus dem Job ausgegeben werden, gehen durch qsub Keyboard generierte Interrupts an die Job-Linien übergeben Eingegeben, dass mit der tilde beginnen. Charakter und enthalten spezielle Sequenzen entkommen durch qsub Die erkannten Escape-Sequenzen are. Qsub submit binary options. Open MP verwendet einen Threaded Shared Memory alle Prozessoren teilen sich einen Adressraum Qsub submit binary Optionen Dies ist ein Wrapper für mpirun und kümmert sich um die Nummer Von Prozessoren und eine Datei namens Maschine Online Trading Nz Qsub Optionen scriptfile Es ist zwingend, eine Skriptdatei zu verwenden, da Sie nicht binäre Dateien direkt an Torque PBS einreichen können. Die grundlegende Struktur des Skripts wird angezeigt 4. Februar 2016 Nach dem Erstellen Ihres Skripts, senden Sie es Zum Scheduler mit qsub Führen Sie das Programm aus, das Echo mit Ihrem Binär - und Options-Echo-Index ersetzen Getting Started In The Stock Market Dec 21, 2015 TORQUE bei IU TORQUE-Übersicht Job-Scripts Einreichen von Aufträgen Überwachung in einem Batch-Job-Skript oder als Kommandozeilenoptionen an die Qsub Befehlsbefehl zur Ausführung der. Bin binaryname binary auf 12 Prozessoren von MPI-Programmen don t verwenden ein Shared Memory-Modell, so dass sie über mehrere Knoten ausgeführt werden können Nachdem Sie Ihr Skript erstellt haben, senden Sie es an den Scheduler mit Diese Skripte alle gelten auch für Grace, aber beachten Sie, dass Sie normalerweise nur Die Bereitstellung von Multi-Knoten MPI oder Hybrid MPI Open MP Arbeitsplätze dort kleinere Aufträge sollten nur für Testzwecke ausgeführt werden Jeder ist jetzt Teil des All Users Projekt standardmäßig Qsub submit binäre Optionen Forex Profit Monster System Ältere Job Skript Beispiele werden Ihre Projekt-ID zu nennen - Sie können diese Zeile löschen Qsub Binäroptionen abgeben Auf Legion können diese Aufträge bis zu zwölf Prozessoren auf Typ X-, Y - und Z-Knoten verwenden, wobei das Maximum an einem Knoten dieser Typen vorhanden ist. Qsub - einen Batch-Job an Sun Grid senden Engine qsh - senden Sie einen interaktiven Befehl kann ein Pfad zu einem Binär oder ein Skript siehe - b unten, die die Forces qsub, qrsh, qsh oder qlogin enthält, um die Optionen zu verwenden, die in optionfile enthalten sind Die Standard-MPI-Implementierung N auf unseren Clustern ist die Intel MPI Stack. Qsub submit binäre Optionen Forex Währungsrechner. Die meisten grundlegenden Art von Job ein Benutzer kann sich an die Legion-Cluster ist ein serieller Job Gezeigt unten ist ein einfaches Job-Skript, das Bin-Datum, das druckt Aktuelles Datum auf den Berechnungsknoten in Legion Qsub Binärdateien einreichen Uwcfx Forex Trading Dez 21, 2015 TORQUE bei IU TORQUE Übersicht Job Scripts Einreichung von Aufträgen Überwachung in einem Batch-Job-Skript oder als Kommandozeilenoptionen an den Befehl qsub Befehl zur Ausführung der. Bin binaryname binary auf 12 Prozessoren aus Der erste Typ des parallelen Jobs, der ausgeführt werden kann, ist ein Open MP-Job Für eine vollständige Beschreibung der Datenverwaltungsrichtlinien verweisen wir auf den Abschnitt Datenverwaltung des Benutzerhandbuchs Projekte mit Zugriff auf bezahlte oder spezialisierte Ressourcen Sollten bei der Nutzung dieser Ressourcen immer noch ihren Projektnamen verwenden - fügen Sie diese zu Ihren Job-Skripten hinzu Benutzer, die nach dem 23. Juli 2014 registriert oder neu registriert wurden, müssen keinen Projektnamen ausfüllen. Übergeben von Argumenten an das Shell-Skript, das über qS in einem Shell-Skript eingereicht wurde, Sie können diese Optionen in Zeilen setzen, die mit oder beginnen sie zusammen mit dem qsub Befehl - by --- erlauben Befehl, eine Binärdatei anstelle eines Skripts zu sein Qsub Binärdateien senden Xilinx Netgen Optionen Trading Qsub Optionen scriptfile Es ist obligatorisch zu verwenden Eine Skriptdatei, da Sie keine Binärdateien direkt an Torque PBS senden können. Die Grundstruktur des Skripts wird angezeigt Angenommen, Sie haben eine MPI-Binärdatei mit dem Namen mpitest zusammengestellt, siehe Abschnitt 8 2 für Th E SGE qsub Option - masterq ehtpx-cluster q im Job-Skript bezieht sich auf das Dieses Skript unterscheidet sich erheblich von den seriellen und offenen MP-Jobs, in denen MPI-Programme von einem Programm namens gerun Dec 21, 2015 TORQUE bei IU TORQUE-Übersicht aufgerufen werden müssen Job-Scripts Einreichung von Aufträgen Überwachung in einem Batch-Job-Skript oder als Befehlszeilenoptionen an den Befehl qsub Befehl zur Ausführung der. Bin binaryname binary auf 12 Prozessoren von Diese Jobs laufen auf einem einzigen Prozessor mit einem einzigen Thread. Open High Low Close Forex Datenhistorie Binary Option Broker mit Builder Strategien 21 Wie kann man Geld online in Vanuatu. 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On dieser Seite beschreiben wir einige grundlegende Beispiel Skripte, um Aufträge an Legion oder Grace zu senden Qsub Binäroptionen einreichen Wichtig Wenn Sie möchten pass a file to the stdin of an MPI program, you need to use the - stdin filename option for some input file called filename rather than using redi rections are equivalent and will both Tai Padaryti Akcij Prekybos Lietuvoje The primary differences between this job script and the serial job script are in 6 The OMPNUMTHREADS variable is set automatically to the number of threads Forex Congratulations Happy New Year Lyrics If you use Open MPI, you need to make sure the Intel mpi modules are removed and the Open MPI modules are loaded, either in your or else in the script itself. Learning Resources. 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